Сергій Морозов тренував декілька футбольних команд. Сергій Морозов працював в Івано-Франківську. У листопаді 1999 року він очолив ФК «Прикарпаття», яке на той час виступало у Вищій лізі. На жаль, досягти завдання, зберегти «прописку» у Вищій лізі в сезоні 1999/2000 років, йому не вдалось. Команда лише за додатковими показниками поступалася «Таврії» та назавжди покинула вищий дивізіон українського футболу, інформують "Вікна".
В Івано-Франківську Сергій Морозов працював дев'ять місяців, до липня 2000 року, після чого покинув команду.
Саме під час роботи в Івано-Франківську йому як тренеру було присвоєне почесне звання «Заслужений тренер України».
Будучи футболістом, виступав за «Зорю» Ворошиловград, у складі якого здобув звання чемпіона СРСР в 1972 році, а також за ЦСКА Москва, «Локомотив» Вінниця, «Десна», «Шахтар» Кадієвка. У двох останніх командах Сергій Морозов грав проти івано-франківського «Спартака», що на той час виступав у Другій лізі СРСР.
По завершенні кар’єри футболіста працювавкрім «Прикарпаття» , в ЦСКА Москва, «Ниві» Вінниця, ЦСКА Київ, «Ворскла» Полтава, «Дніпро» Черкаси.